Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx27Q3UHD6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms