Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms