Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms