Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf180Q3U827 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rnf180Q3U827 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf180Q3U827 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rnf180Q3U827 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf180Q3U827 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf180Q3U827 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf180Q3U827 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf180Q3U827 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf180Q3U827 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf180Q3U827 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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