Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms