Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc9Q3U0M1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms