Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srsf6Q3TWW8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srsf6Q3TWW8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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