Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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