Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim7Q3TJD7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim7Q3TJD7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim7Q3TJD7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim7Q3TJD7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim7Q3TJD7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim7Q3TJD7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms