Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Usp39Q3TIX9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp39Q3TIX9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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