Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc13Q3TIR1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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