Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zbtb38Q3LR78 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms