Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrna5Q2MKA5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms