Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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