Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cers3Q1A3B0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms