Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptcd3Q14C51 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms