Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ptchd1Q14B62 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ptchd1Q14B62 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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