Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms