Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms