Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vps8Q0P5W1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vps8Q0P5W1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms