Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms