Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnnm1Q0GA42 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm1Q0GA42 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms