Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms