Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfe2Q07279 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nfe2Q07279 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms