Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrx2Q06348 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrx2Q06348 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms