Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms