Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms