Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms