Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs2Q03350 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Thbs2Q03350 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms