Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Runx1Q03347 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms