Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PrkcqQ02111 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms