Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms