Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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