Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mc1rQ01727 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms