Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms