Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23aQ01405 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms