Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top2aQ01320 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms