Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms