Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbp1Q00915 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbp1Q00915 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms