Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms