Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Itga4Q00651 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms