Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms