Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms