Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SmsP97355 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SmsP97355 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SmsP97355 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SmsP97355 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms