Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms