Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabpb2P81069 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms