Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Irx1P81068 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Irx1P81068 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Irx1P81068 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Irx1P81068 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Irx1P81068 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx1P81068 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx1P81068 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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