Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms