Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms