Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfixP70257 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfixP70257 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms